La situazione sanitaria colombiana non è diversa da quella dei suoi paesi vicini; è
difficile nelle zone amazzoniche, come pure nelle regioni ad est della cordigliera andina (Llanos) e costa del Pacifico, con la presenza di malaria, dengue e febbre gialla. Talvolta si sono verificati in alcune aree del Paese casi di colera. Previo parere medico, si consiglia la profilassi antimalarica per coloro che intendono recarsi nelle zone della costa pacifica, Amazzonica e Llanos orientali, dove è anche presente il dengue. Sempre previo parere medico, è consigliabile la vaccinazione contro la febbre gialla per la costa nord del Paese. Sono inoltre molto diffuse varie forme di infezioni intestinali, che si contraggono attraverso l'assunzione di acqua corrente.
Si suggerisce di bere solo acqua minerale e bibite sigillate, senza aggiungere ghiaccio, o in sua mancanza, di far bollire l'acqua. Evitare di mangiare carne, pesce e verdura cruda; come pure, è consigliabile sbucciare sempre la frutta.